เมื่อสิ่งมีชีวิตประหลาดรูปร่างคล้ายปลาหมึกสีเหลืองที่มีพลังทำลายล้างดวงจันทร์ไปกว่าครึ่งประกาศว่าจะทำลายโลกในอีก 1 ปีข้างหน้า แต่กลับยื่นข้อเสนอขอมาเป็นครูประจำชั้นห้อง 3-E ของโรงเรียนมัธยมต้นคุนุกิงาโอกะ เหล่านักเรียนในห้องนี้จึงได้รับมอบหมายภารกิจจากรัฐบาลให้เป็น “มือสังหาร” เพื่อกำจัดครูที่พวกเขาเรียกว่า “อาจารย์โคโระ” (Koro-sensei) โดยมีเงินรางวัลมหาศาลเป็นเดิมพัน ท่ามกลางการฝึกฝนทักษะการฆ่า พวกเขากลับได้เรียนรู้บทเรียนชีวิตที่มีค่าที่สุดจากเป้าหมายของพวกเขาเอง