เมื่อยักษ์จากตำนานญี่ปุ่นอย่าง “คุจิกิ” และ “มิมิฮิโกะ” ปรากฏตัวขึ้นเพื่อตามล่าอัญมณีลึกลับที่จะช่วยให้พวกมันครองโลกได้ โคทาโร่ (เดนโอรุ่นใหม่) จึงต้องร่วมมือกับ เรียวทาโร่ และพวกพ้องอิมาจิน รวมถึง คาโดะ สึคาสะ (มาสค์ไรเดอร์ดีเคด) เพื่อย้อนเวลากลับไปยังยุคมุโรมะจิและหยุดยั้งแผนการเดินเรือยักษ์โอนิงาชิมะ