โนบิตะและเพื่อนๆ ตัดสินใจ “หนีออกจากบ้าน” เพราะเบื่อหน่ายกับชีวิตประจำวันและการถูกดุด่า พวกเขาจึงใช้ไทม์แมชชีนย้อนเวลากลับไปเมื่อ 70,000 ปีก่อน ในยุคที่ประเทศญี่ปุ่นยังไม่มีคนอาศัยอยู่เพื่อสร้างอาณาจักรของตัวเอง ต่อมาพวกเขาได้พบกับ “คุคุรุ” เด็กชายจากเผ่าแสงสว่างที่หลงยุคมา และได้รู้ว่าเผ่าของเขาถูกรุกรานโดยกองทัพอมนุษย์ที่มี “กีก้าซอมบี้” ผู้วิเศษจอมชั่วร้ายเป็นผู้นำ โดราเอมอนและเพื่อนๆ จึงต้องออกเดินทางสู่จีนแผ่นดินใหญ่เพื่อต่อสู้กับวายร้ายจากอนาคตและปกป้องประวัติศาสตร์ของมนุษยชาติไว้