เมื่อมนุษย์ต่างดาวเผ่าพันธุ์ “เอ็กซิเลี่ยน” (Xiliens) บุกโลกและใช้เทคโนโลยีควบคุมเหล่าสัตว์ประหลาด (Kaiju) ออกมาทำลายล้างเมืองสำคัญทั่วโลก กองกำลังป้องกันโลก (G-Force) จึงตัดสินใจทำแผนการสุดท้าย คือการปลุก “ก็อดซิลลา” ที่ถูกจองจำอยู่ในน้ำแข็งที่ขั้วโลกใต้ให้ตื่นขึ้นมาอีกครั้ง เพื่อเป็นความหวังเดียวในการกำจัดสัตว์ประหลาดทั้ง 13 ตัว และเผชิญหน้ากับศัตรูที่ร้ายกาจที่สุดอย่าง “ไคเซอร์ กิโดร่า”