“มุซาชิ” ในวัยหนุ่มได้ทำตามความฝันในการเป็นนักบินอวกาศ เขาได้เดินทางไปยังเกาะไซปันและพบกับมนุษย์ต่างดาว “ชอว์” และ “ยีน” ...

เรื่องราวเกิดขึ้นก่อนเหตุการณ์ในทีวีซีรีส์ “มุซาชิ” เด็กชายผู้เชื่อมั่นในตัวตนของมนุษย์ยักษ์และสัตว์ประหลาด ได้พบกับ อุลตร้าแมนคอสมอส ที่ได้รับบาดเจ็บจากการต่อสู้กับมนุษย์ต่างดาว ...