หลังจากเหตุการณ์ใน Batman Ninja (2018), แบทแมนและพันธมิตรกลับมายัง Gotham City ปัจจุบัน แต่กลับพบว่า “ญี่ปุ่น” (Japanese island) ได้หายไป และมีเกาะลอยบนท้องฟ้าเหนือเมืองก็อตแธม ชื่อ “Hinomoto” ...

Justice League หายตัวไปอย่างลึกลับ เหล่าวายร้ายบุก Hall of Justice Scooby-Doo และ Mystery Inc. จึงต้องร่วมมือกับ Krypto the Superdog เพื่อไขปริศนาลึกลับ คืน Justice League ...