เข้าสู่ช่วงเทอมที่ 2 ของเหล่านักเรียนห้อง 3-E ภารกิจสังหารอาจารย์โคโระยังคงดำเนินต่อไป แต่ความกดดันเพิ่มขึ้นเมื่อเวลาที่โลกจะถูกทำลายใกล้เข้ามาทุกที พวกเขาต้องเผชิญกับศัตรูใหม่ๆ ...