เมื่อภัยคุกคามใหม่จาก “แบทเซจิน” และสัตว์ประหลาดในตำนาน “ไฮเปอร์เซ็ตตั้น” บุกทำลายล้างโลกในมิติขนานจนมนุษย์เกือบสูญสิ้น เหลือเพียงกลุ่มเด็กและกองกำลังหญิงอาสา Team U ที่คอยปกป้อง อุลตร้าแมนซีโร่, อุลตร้าแมนไดน่า และ อุลตร้าแมนคอสโมส จึงต้องผนึกกำลังกัน แต่ด้วยความแข็งแกร่งที่เหนือชั้นของศัตรู ทำให้นักรบทั้งสามต้องรวมร่างกันเป็นหนึ่งเดียวเพื่อกำเนิดนักรบแห่งปาฏิหาริย์ “อุลตร้าแมนซาก้า”