เมื่อสพันจ์บ็อบหายตัวไปอย่างลึกลับจากบิกินีบอททอม พรรคพวกสุดเพี้ยนนำโดย แพทริค สตาร์ จึงต้องออกเดินทางผจญภัยครั้งใหญ่สู่ดินแดนที่ลึกที่สุดและอันตรายที่สุดในมหาสมุทรเพื่อตามหาเพื่อนรักกลับมา ...

Woody ถูกไล่ออกจากป่าเพราะก่อเรื่องกับคนนำค่าย เขาตัดสินใจไปอยู่ค่ายเด็กชื่อ Camp Woo Hoo เพื่อเรียนรู้การทำงานเป็นทีม แต่มีกลุ่มค่ายคู่แข่ง (Camp Hoo Rah) และตัวละครวายร้าย Buzz Buzzard ...

ชีวิตรักวุ่น ๆ ของ Plankton กับ Karen ที่พลิกหลัง เมื่อ Karen ทิ้งเขาแล้ววางแผนจะทำลายโลก ชวน SpongeBob และกลุ่ม Gal Pals มาช่วยหยุด!