เมื่อสพันจ์บ็อบหายตัวไปอย่างลึกลับจากบิกินีบอททอม พรรคพวกสุดเพี้ยนนำโดย แพทริค สตาร์ จึงต้องออกเดินทางผจญภัยครั้งใหญ่สู่ดินแดนที่ลึกที่สุดและอันตรายที่สุดในมหาสมุทรเพื่อตามหาเพื่อนรักกลับมา โดยครั้งนี้พวกเขาต้องเผชิญหน้ากับศัตรูใหม่และอุปสรรคที่ไม่เคยพบเจอมาก่อน ท่ามกลางความวุ่นวายที่อาจสั่นคลอนโลกใต้ทะเล!