เรื่องย่อ ในฤดูกาลที่ 3, การเดินทางในช่วงฤดูร้อนของเบ็นเริ่มเข้าสู่ช่วงที่เข้มข้นและจริงจังยิ่งขึ้น, เบ็นต้องเผชิญหน้ากับศัตรูหน้าใหม่และศัตรูเก่าที่กลับมาพร้อมพลังที่เพิ่มขึ้น, เขาต้องใช้ไหวพริบและเอเลี่ยนตัวใหม่ ๆ จาก Omnitrix เพื่อปกป้องโลกและผู้คนใกล้ชิดให้รอดพ้นจากอันตราย