โคโดะโนนร่วมมือกับคู่แข่ง-เพื่อน Heiji Hattori ขณะเดินทางไปยัง เกียวโต เพื่อไขคดีความผิดปกติหลายคดีที่เชื่อมโยงกับ แก๊งค์โจรเก็นจิโบตารุ ซึ่งเป็นฆาตกรฆ่าลำดับตามตัวเลขในชื่อ เช่น Hachirō (8), Shichirō (7)… จึงเริ่มไล่ลำดับจนมาถึง Hojiro Mori (โคโกโร่) โคนันและเฮอิจิต้องนำพระพุทธรูปศักดิ์สิทธิ์ที่ถูกขโมยกลับคืน ปะทะกับฆาตกร และเผยเบื้องหลัง “ความปรารถนาได้กลับไปเป็นตัวละครในตำนานเกียวโต”