เรื่องราวในเส้นทางที่ 2 ของสงครามจอกศักดิ์สิทธิ์ครั้งที่ 5 เมื่อ “เอมิยะ ชิโร่” ต้องเผชิญหน้ากับความจริงของอุดมการณ์ตนเองผ่านการต่อสู้กับ “อาร์เชอร์” เซอร์แวนท์ของรินผู้ที่มีความลับเบื้องหลังอันซับซ้อน ชิโร่ต้องตัดสินใจว่าจะยังคงยึดมั่นในการเป็นผู้ผดุงความยุติธรรมต่อไปหรือไม่ ท่ามกลางการต่อสู้กับศัตรูที่แข็งแกร่งอย่าง “กิลกาเมช” และความพยายามที่จะก้าวข้ามขีดจำกัดของตัวเองในฐานะจอมเวท