นักบินสองคนบังเอิญไปพบเกาะร้างแห่งหนึ่งและได้เห็นภาพเหตุการณ์สุดระทึก เมื่อ “ก็อดซิลล่า” ตัวที่สองกำลังต่อสู้อย่างดุเดือดกับสัตว์ประหลาดหนาม “แองกิรัส” ก่อนที่ทั้งคู่จะเคลื่อนพลเข้าสู่เมืองโอซาก้า กลายเป็นสมรภูมิยักษ์ที่สร้างความหายนะครั้งใหญ่ให้กับญี่ปุ่นอีกครั้ง มนุษยชาติต้องหาทางหยุดยั้งพวกมันก่อนที่เมืองจะราบเป็นหน้ากลอง