เมื่อหัวใจปฏิกรณ์นิวเคลียร์ของก็อดซิลลาเกิดภาวะวิกฤตและกำลังจะระเบิด (Meltdown) ร่างกายของมันจึงเปลี่ยนเป็นสีแดงฉานและมีอุณหภูมิสูงมหาศาล ซึ่งอาจทำลายล้างโลกได้ ในขณะเดียวกัน อาวุธ “ออกซิเจน เดสทรอยเยอร์” จากปี 1954 ได้ปลุกชีพสัตว์ประหลาดดึกดำบรรพ์ตัวใหม่นั่นคือ “เดสทรอยย่า” อสูรกายที่วิวัฒนาการได้หลายร่างและร้ายกาจที่สุดเท่าที่เคยมีมา นี่คือการต่อสู้ครั้งสุดท้ายของก็อดซิลลาเพื่อปกป้องลูกชาย (Godzilla Junior) และการเสียสละครั้งยิ่งใหญ่เพื่อยุติยุคสมัยของตนเอง