หายนะได้เริ่มต้นขึ้นเมื่อกองทัพศัตรูขนาดใหญ่จากโลกอนาคตบุกโจมตีผ่านประตูมิติเวลา โฮทาโร่ หรือ คาเมนไรเดอร์ ก๊อตชาร์ด และผองเพื่อนต้องต่อสู้อย่างสุดกำลัง ในอดีตพวกเขาเคยได้รับความช่วยเหลือจาก คาเมนไรเดอร์ ก๊อตชาร์ด เดย์เบรก ผู้ลึกลับ (โฮทาโร่ในอีก 20 ปีข้างหน้า) แต่ครั้งนี้ สถานการณ์กลับตาลปัตรเมื่อสัมผัสได้ถึงอันตรายที่กำลังคืบคลานในอนาคต โฮทาโร่และเพื่อนๆ จึงตัดสินใจแน่วแน่ว่าครั้งนี้พวกเขาต้องเป็นฝ่ายไปช่วยบ้าง พวกเขาจึงใช้ กิกันท์ไลเนอร์ เดินทางข้ามมิติเวลา พุ่งทะยานสู่การผจญภัยครั้งยิ่งใหญ่ในโลกอนาคตที่เดย์เบรกกำลังรออยู่ มาร่วมต่อสู้ข้ามกาลเวลาในศึกที่จะกำหนดชะตากรรมของทั้งสองยุค