ในฤดูกาลที่ 2, Clark Kent ต้องเรียนรู้เพิ่มเติมเกี่ยวกับต้นกำเนิดของชาว Kryptonian และพันธกิจของเขาบนโลก, ในขณะเดียวกันเขาก็ต้องรับมือกับความท้าทายที่ใหญ่ขึ้นทั้งในด้านความสัมพันธ์กับ Lois Lane ที่กำลังพัฒนาไปข้างหน้า และการเผชิญหน้ากับวายร้ายที่มีพลังแข็งแกร่งกว่าเดิมหลายเท่า, รวมถึงภัยคุกคามจากองค์กรลับที่จับตามองเขาอยู่