เล็กซ์ ลูเธอร์ ได้ค้นพบ เครื่องรางของชาวคริปโตเนียน ที่กักขังเทพธิดาแห่งความมืดมิด ไซโธนนา ไว้ เขาใช้พลังจากเครื่องรางนี้รวบรวมเหล่า สุดยอดวายร้าย (Legion of Doom) เพื่อจับกุมและกักขังฮีโร่ผู้ใหญ่ทั้งหมดของโลกไว้ใน แฟนธอม โซน (Phantom Zone)

ทำให้เหลือเพียงทีม DC Super Hero Girls ที่ต้องเป็นความหวังสุดท้ายในการกอบกู้จักรวาล เมื่อพวกเธอพยายามหาทางข้ามมิติเพื่อช่วยเหลือเพื่อนฮีโร่ พวกเธอกลับไปโผล่ที่ ไททันส์ ทาวเวอร์ โดยบังเอิญและได้พบกับเหล่า Teen Titans Go! ที่เอาแต่ใช้ชีวิตแบบไร้สาระ ทีม Super Hero Girls จึงต้องจำใจรวมกลุ่มกับ Teen Titans เพื่อนำความสามารถและอารมณ์ขันอันวายป่วงมาใช้ในการต่อสู้กับกองทัพวายร้ายและกอบกู้โลกจากมหันตภัยมัลติเวิร์สครั้งนี้ให้ได้