เหตุการณ์ในภาพยนตร์เกิดขึ้นในปี 2012 สิบปีหลังจากที่กลุ่ม เด็กผู้ถูกเลือก (DigiDestined) รุ่นที่สอง (จากซีรีส์ Digimon Adventure 02) ได้ผจญภัยในโลกดิจิทัล ปัจจุบันพวกเขาทุกคนอยู่ในวัยยี่สิบและกำลังเผชิญหน้ากับการเปลี่ยนผ่านเข้าสู่ชีวิตวัยผู้ใหญ่

จุดเริ่มต้น: จู่ ๆ ก็มี “ไข่ดิจิ” (Digitama) ขนาดยักษ์ปรากฏขึ้นลอยอยู่เหนือ โตเกียวทาวเวอร์ พร้อมส่งข้อความลึกลับที่ต้องการให้ทุกคนบนโลกได้มีคู่หู ดิจิมอน

เด็กผู้ถูกเลือกคนแรก: ไดสึเกะ (Davis) และเพื่อน ๆ ได้พบกับชายหนุ่มลึกลับชื่อ ลุย โอวาดะ (Lui Ohwada) ที่อ้างว่าตนเองคือ เด็กผู้ถูกเลือกคนแรกของโลก และเป็นจุดเริ่มต้นของการมีอยู่ของเด็กผู้ถูกเลือกทุกคน

ความจริงที่ถูกซ่อนไว้: การเผชิญหน้ากับลุยและไข่ดิจิขนาดยักษ์นำไปสู่การเปิดเผยความจริงอันน่าเศร้าและอ่อนโยนที่อยู่เบื้องหลังการกำเนิดของ “เด็กผู้ถูกเลือก” และคู่หูดิจิมอน ซึ่งอาจเปลี่ยนแปลงความเข้าใจที่พวกเขามีต่อความสัมพันธ์ของตนเองไปตลอดกาล