กลุ่มผู้ก่อการร้ายสากล “NEVER” นำโดย คัตสึมิ ไดโดะ ได้บุกปล้น T2 ไกอาเมมโมรี่ 26 ชิ้นและเข้ายึดครองเมืองฟูโตะ ไดโดะสามารถแปลงร่างเป็น “มาสค์ไรเดอร์อีเทอร์นัล” ที่มีพลังในการระงับเมมโมรี่รุ่นเก่าทั้งหมดได้ โชทาโร่และฟิลิปจึงต้องเผชิญกับวิกฤตครั้งใหญ่ที่สุดเพื่อปกป้องเมืองอันเป็นที่รักจากแผนการทำลายล้างครั้งนี้