เรื่องราวของแก๊ง Mystery Inc. ทั้ง 5 คน ได้แก่ เฟรด, แดฟนี่, เวลม่า, แช็กกี้ และ สกูบี้-ดู ที่อาศัยอยู่ในเมือง Crystal Cove ซึ่งเป็นเมืองที่ขึ้นชื่อว่า “มีผีสิงมากที่สุดในโลก” ในตอนแรกพวกเขายังคงไขคดีหลอกๆ ตามสูตรเดิม แต่ไม่นานก็ต้องไปพัวพันกับปริศนาลึกลับที่แท้จริงและเป็นความลับอันถูกปิดตายของเมืองนี้ ซึ่งนำไปสู่การค้นพบเรื่องราวของกลุ่ม Mystery Incorporated รุ่นแรกที่หายตัวไปเมื่อ 20 ปีก่อน และคำสาปโบราณของเมืองที่เชื่อมโยงกับเรื่องเล่าจากบาบิโลน