ในยุคที่โชกุนโตกุกาวะต้องการกำจัดเหล่านินจาผู้มีพลังเหนือมนุษย์ให้สิ้นซาก เขาจึงวางแผนให้สองหมู่บ้านนินจาคู่อริอย่าง “อิงะ” และ “โคงะ” ส่งสุดยอดฝีมือหมู่บ้านละ 5 คนมาสู้กันจนกว่าจะตายไปข้างหนึ่ง ท่ามกลางสงครามนี้ “เกนโนะสุเกะ” และ “โอโบโระ” ทายาทของทั้งสองหมู่บ้านที่แอบหลงรักกัน ต้องเลือกระหว่างความรักที่มีให้กันหรือหน้าที่ที่จะต้องเข่นฆ่าฝ่ายตรงข้ามเพื่อความอยู่รอดของหมู่บ้านตนเอง